研究人員發現，生奶（原料乳）與巴氏殺菌奶的消化率差別不大，2014年3月/4月版的家庭醫學年報（ Annals of Family Medicine）上發表了斯坦福大學的這一研究。但生奶的支持者對此研究結果的解釋持懷疑態度。

研究人員根據經批準的乳糖吸收障礙醫學測試（氫呼氣測試）的結果挑選了實驗參與者。研究人員稱，生奶并未減少氫的含量，這表明與巴氏殺菌奶相比，乳糖吸收障礙或不耐受癥狀沒有得到改善。這所大學給此調查結果的標題是，“生奶減少乳糖不耐受癥的聲稱沒有通過氣味（直覺）測試。”

這一研究結果與許多對生奶滿意，卻抱怨巴氏殺菌奶難消化的飲用者的個人經驗相沖突。

對于斯坦福大學的研究，批評家指出設計上的漏洞、對照組和樣本量的選擇導致研究人員得出了錯誤的結論。

例如，在篩選了440個聲稱在消化牛奶方面有問題的申請者后，研究人員只選擇了其中的十六個人。

原料乳研究所董事長Mark McAfee對從這樣一個小樣本得出的結論提出質疑。 “該研究實際上表明，氫呼氣試驗不足以在97％的研究申請人中診斷乳糖的消化問題。大多數人都沒有明顯的乳糖不耐受癥，卻可以更好地描述為巴氏殺菌奶不耐癥，對此，醫學科學可能還沒有一個合適的測試方法。”

批評家也對使用豆奶作為對照提出質疑。韋斯頓A價格基金會為此次研究提供了部分資金，該基金會總裁Sally Fallon Morell稱，“我們聽到報道說豆奶會使很多人消化不良和胃腸脹氣。然而，根據氫呼氣測試，它比生奶和巴氏殺菌奶更易消化。這項研究的設計有嚴重缺陷，不適合用于測定所有牛奶的消化率。”

原料乳研究所也為這項研究提供了經費，聲稱該研究的簡短性限制了它的價值。

斯坦福大學的研究參與者每種類型的牛奶只喝了八天。Mark McAfee解釋說：“益生菌在一個嚴重的乳糖不耐受癥的人的腸道內重新定殖的時間要超過8天。這些益生菌產生乳糖酶，能幫助消化乳糖。”McAfee指出，為了在氫呼氣測試中有顯著的改善，益生菌重新定殖需要更多的時間。事實上，H₂呼吸測試確實說明研究中所挑選的16名嚴重的乳糖不耐受癥人員有輕微改善。“隨著時間的增多，我們可能會看到統計數據上顯著的改善，”McAfee說。

2013年12月，原料乳研究所援引多個同行評審的研究和國際上發表的說明原生牛奶有很多益處的文章，對美國兒科學會反對食用生牛奶的立場做出了回應。在科學上得到證實的好處包括預防哮喘、過敏和濕疹并改善嬰兒的增重。

2007年，對密歇根州擁有新鮮未加工的奶牛股份合同的奶農和家庭中的2503位受訪者進行了試點調查。6％的受訪者被診斷為有乳糖不耐受癥，84％的人說，他們能喝新鮮未加工的牛奶，而且沒有任何喝商業A級的巴氏殺菌和均質牛奶時的癥狀。這個2007年的調查受韋斯頓A.價格基金會的委托。

“現今，在美國有超過一千萬人喜歡喝生奶，”Fallon Morell說。“研究人員需要注意市場趨勢所表明的是：很多人在通過改變飲食解決消化問題。”